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NEJM:胎兒DNA檢測新時代

2014-03-13 10:25 閱讀:1370 來源:醫(yī)脈通 責任編輯:李思杰
[導讀] DNA測序已經(jīng)以一種戲劇性的全新方式進入了醫(yī)療界:在早早孕時期檢測染色體缺陷。25年來,我們知道,胎兒的DNA痕跡可以通過懷孕母親的血液來進行檢測,然而這些痕跡非常之小,而且到目前為止,我們尚沒有技術來檢測到DNA正常的多余染色體。 上周,在《新英格

    DNA測序已經(jīng)以一種戲劇性的全新方式進入了醫(yī)療界:在早早孕時期檢測染色體缺陷。25年來,我們知道,胎兒的DNA痕跡可以通過懷孕母親的血液來進行檢測,然而這些痕跡非常之小,而且到目前為止,我們尚沒有技術來檢測到DNA正常的多余染色體。
 


    上周,在《新英格蘭醫(yī)學雜志》(The New England Journal of Medicine)上發(fā)表的一篇研究文章中,戴安娜 碧昂琪(Diana Bianchi)和她的同事們向我們展示了,DNA測序如何能以驚人的準確率幫助檢測到多余的染色體。這篇報告開啟了胎兒DNA檢測的新時代。

    首先讓我們來了解一些背景知識:人體的第21對染色體多出一條變成三條就會引起唐氏綜合征(Down syndrome),這種遺傳學疾病導致智力缺陷和生長遲緩。唐氏綜合征也被稱為“21-三體綜合征”,“三體”即染色體變成三條而不是正常的兩條。更為少見的愛德華茲綜合征(Edwards syndrome)則由人體第18對染色體的三體變異導致,故而又稱“18-三體綜合征”,其后果要嚴重得多,大部分妊娠會中途發(fā)生終止。而其他染色體的三體變異也通常會導致早產(chǎn)或流產(chǎn)。出于多種原因,準爸媽們都想要知道胎兒是否攜帶這種不正常的變異因素。

    上述新檢測法的精確率令人印象深刻。在1,914名健康的年輕懷孕婦女中,僅有8人的胎兒染色體出現(xiàn)多余,而這一測試方法將全部8例都檢測了出來。最令人印象深刻的是其較低的假陽性率:總體而言,這一新DNA檢測法僅報告9例假陽性(21-三體變異或18-三體變異),而傳統(tǒng)的篩查測試盡管也發(fā)現(xiàn)了全部的8例真陽性案例,其假陽性結果卻高達80例,幾乎是DNA測序法的9倍之多。

    為何這一方法如此重要?在大部分情況下,得到陽性結果的女性會選擇羊膜穿刺術,這是一種侵入性檢查,醫(yī)生會用一根長針直接穿入子宮,采集一些羊水樣本。一般情況下,羊膜穿刺術能對唐氏綜合征做出一個確定的鑒定。采用傳統(tǒng)方法的假陽性率非常之高,羊膜穿刺術可推翻95%以上的假陽性結論,而新的DNA測序法的這一比例則僅為55%?;蛘哂帽贪虹鞯热说脑拋碚f: “如果所有得到陽性結果的女性選擇進行入侵性檢查,那么診斷性入侵性檢查的數(shù)量將減少89%。”入侵性檢查的數(shù)量減少89%,這可是一個巨大的幅度,不僅僅意味著成本的降低,也意味著父母壓力和胎兒風險的減少(羊膜穿刺術可能會引起流產(chǎn))。

    DNA測序法每一年都在變得速度更快、費用更便宜,所以,現(xiàn)在看到這種方法僅被用于檢測三染色體細胞,不免令我們有些吃驚。

    檢測多余染色體的困難之處在于,DNA基因序列本身是正常的。如果你對基因進行測序,你不會發(fā)現(xiàn)任何顯示胎兒擁有多余染色體的變異。而這就是下一代基因測序技術驚人效率起作用的地方。

    現(xiàn)代測序儀器能在短短幾小時時間內(nèi)對數(shù)百萬DNA小碎片進行采樣。我們可以使用計算機分析法來確定哪些碎片來自于胎兒,以及哪些碎片來自于每條染色體。

    如果任何染色體出現(xiàn)了三條,那么該條染色體DNA增加的幾率上升了50%?;驕y序的力量來自于其以大量數(shù)據(jù)為依托:因為我們可以對每條染色體的許多碎片進行測序,那么50%的上升幾率就會較為容易地被檢測到。

    碧昂琪所采用的檢測三體變異的方法是2011年艾米 賽奈特(Amy Aehnert)及其同事的研究成果,其中一些人也是上述新研究報告的參與者(注:他們使用的是一種名為Bowtie的軟件項目來進行分析,該軟件由我的學生本 蘭米德[Ben Langmead]開發(fā))。這一方法將隨著時間的推移而變得更好:進一步降低假陽性率。

    美國婦產(chǎn)科醫(yī)師協(xié)會(American College of Obstetricians and Gynecologists)早已建議有胎兒染色體異常(多余染色體)風險的孕婦采用DNA檢測。確切來說,他們建議高風險孕婦在獲得遺傳學咨詢之后,擁有做胎兒DNA檢測的選擇權。上述研究是在低風險孕婦人群中進行的,其表明,產(chǎn)前DNA測試的益處應該讓所有女性都有權利享受到。


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