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中美科學(xué)家成功繪制大鼠轉(zhuǎn)錄組圖譜

2014-02-14 11:18 閱讀:1056 來源:醫(yī)學(xué)論壇網(wǎng) 責(zé)任編輯:林曉楓
[導(dǎo)讀] 中美科研人員利用高通量序列測定來測序和定量RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析的方法,對來自幼年、青春期、成年及老年的雌雄且具有正常免疫功能的Fischer344大鼠、涵蓋11種器官和4個(gè)發(fā)育階段的大鼠320個(gè)樣本進(jìn)行了RNA測序,由此構(gòu)建出了一張綜合大鼠轉(zhuǎn)錄組圖譜,繪制出400

    中美科研人員利用高通量序列測定來測序和定量RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析的方法,對來自幼年、青春期、成年及老年的雌雄且具有正常免疫功能的Fischer344大鼠、涵蓋11種器官和4個(gè)發(fā)育階段的大鼠320個(gè)樣本進(jìn)行了RNA測序,由此構(gòu)建出了一張綜合大鼠轉(zhuǎn)錄組圖譜,繪制出40064個(gè)基因和65167種轉(zhuǎn)錄物表達(dá)譜。

    由復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院石樂明教授和美國洛馬林達(dá)大學(xué)CharlesWang博士作為共同通訊作者的反應(yīng)該研究成果的論文,于2月10日發(fā)表在《自然·通訊》雜志上。專家認(rèn)為,該大鼠轉(zhuǎn)錄組圖譜可與其他數(shù)據(jù)庫交聯(lián),通過網(wǎng)絡(luò)獲取,為利用大鼠模型開展生物醫(yī)學(xué)研究提供了一個(gè)重要的資源。

    大鼠可用來開展藥物和化學(xué)毒性測試,評估潛在藥物效應(yīng)機(jī)制,以及模擬人類疾病。利用RNA測序編寫出從出生到老年整個(gè)大鼠生命期以及兩性之間的轉(zhuǎn)錄組差異變化表,能夠提供關(guān)于疾病易感性、藥物療效與安全性、毒性機(jī)制的一些新認(rèn)識,最終促使一些臨床前研究成果轉(zhuǎn)化應(yīng)用于人類疾病防止。

    科研人員還發(fā)現(xiàn)了一些器官富集、差異性表達(dá)的基因,反映出已知的器官特異性生物活性。大量的轉(zhuǎn)錄物還顯示出器官特異性、年齡依賴性或性別特異性的差異表達(dá)模式。


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